水处理设备中膜的化学清洗的方法很多，按化学清洗剂的种类可分为碱清洗、酸清洗、表面活性剂清洗、络合剂清洗、聚电解质清洗、消毒剂清洗、有机溶剂清洗、复合型药剂清洗和清洗等。

(1)碱清洗
碱清洗的药剂有氢氧化物、碳酸盐、磷酸盐、过硼酸盐等。
氢氧化物能溶解SiO₂和蛋白质、皂化脂类等，如2NaOH+SiO₂一NazSiO₃+H₂O
碳酸盐和磷酸盐的碱性很弱，一般用来调节pH，磷酸盐还常用做分散剂；过硼酸钠可用于清洗膜孔内的胶体物质。
(2)酸清洗
酸清洗的药剂有盐酸、硫酸、硝酸、磷酸、氨基磺酸、氢氟酸等。酸能有效地去除碳酸盐组成的硬垢和金属氧化物盐垢，这些酸与金属的碳酸盐或氧化物反应，使之转变为可溶性金属盐类。
发生的化学反应如下：
CaCO₃+2H⁺一Ca²⁺+H₂O+CO₂
FeO+2H⁺一Fe²⁺+H₂O
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